Санкт-Петербургский госуниверситет стал первым российским университетом, которому Фонд Цукерберга выплатил грант. С помощью этих средств ученые-биоинформатики разработают проекты по расшифровке геномов. Эта работа станет значимой для тысяч специалистов по всему миру, сообщает пресс-служба вуза.
Получателями гранта от фонда Цукерберга стали специалисты Центра алгоритмической биотехнологии СПбГУ. Они работают над двумя важными проектами в области генома — SPAdes и QUAST.
Задача программы SPAdes, которая расшифровывается как Saint Petersburg Assembler, — восстановление полной первичной структуры геномной ДНК. Фактически речь идет о расшифровке генетического кода. Эта разработка является флагманским продуктом лаборатории. Ее используют тысячи ученых в исследованиях генома во всем мире.
Другой проект — QUAST, или Quality Assessment Tool, — это программа для определения качества геномных сборок. В ней также можно проводить их сравнение, поскольку она способна анализировать несколько сборок одновременно. Поэтому обе программы вошли в один геномный проект. Они позволяют чередовать оценку качества данных со сборкой данных, оценкой качества сборки и выполнять научный анализ.
По словам замдиректора Центра алгоритмической биотехнологии Института трансляционной биомедицины СПбГУ Аллы Лапидус, любой хороший продукт всегда требует достойной технической поддержки, а это масштабная и дорогостоящая работа, для которой требуются высококвалифицированные участники.
«SPAdes и QUAST являются программами с открытым исходным кодом, и компаниям невыгодно поддерживать их финансово. «Инициатива Чан — Цукерберга» тем и ценна, что при распределении грантов она учитывает не только роль научной составляющей, но и потребность в дорогой «ненаучной» составляющей, без которой науке не на что опираться», — сказала она.
«Инициатива Чан — Цукерберга» (Chan Zuckerberg Initiative) — благотворительный фонд, который супруги Марк Цукерберг и Присцилла Чан создали в 2015 году. Задача этой организации — помогать решать сложные социальные проблемы, например, лечить болезни, или улучшать качество образования.
Фото: iStock by Getty Images
